Norą dalyvauti Tūkstantmečio mokyklų programoje pareiškė 54 iš 60-ies Lietuvos savivaldybių, skelbia Švietimo, mokslo ir sporto ministerija. Anot ministrės J. Šiugždinienės, programos metu bus reikalaujama įgyvendinti Europos Komisijos iškeltus tikslus, tarp kurių – mokinių rezultatų ir mokytojų darbo sąlygų gerėjimas.

ŠMSM numato, kad pirmajam Tūkstantmečio mokyklų programos etapui numatyta 210 mln. eurų, jie bus skiriami savivaldybėms, kuriose mokosi 10–15 tūkst. moksleivių, savivaldybės galės pretenduoti į maždaug 5,5 mln. eurų krepšelį. Pirmuoju etapu į programą turėtų įsitraukti iki 150 mokyklų.