„Atsakomybė išplauta, o rezultatai – nematuojami“, – taip „Tūkstantmečio mokyklų“ programą vertina žurnalo „Reitingai“ vyriausiasis redaktorius Gintaras Sarafinas. Anot jo, reformą ir pinigų skirstymą reikėtų sieti su bendrais, pamatuojamais ir įrodomais pasiekimais, kurie būtų vienodai suprantami ir Kelmėje, ir Rokiškyje, ir Vilniuje.

„Tūkstantmečio mokyklų“ programą komentuoja Vilniaus švietimo pažangos centro direktorė, ekspremjero Sauliaus Skvernelio patarėja švietimo klausimais Unė Kaunaitė.