UNESCO yra vienintelė unikali Jungtinių Tautų agentūra, turinti aktyviai veikiantį valstybių narių atstovų – nacionalinių UNESCO komisijų – tinklą, paremtą tarpusavio bendradarbiavimu. Nacionalinėms UNESCO komisijoms tenka svarbūs konsultavimo, informacijos mainų, partnerystės įgyvendinimo uždaviniai, jos atlieka didžiulį vaidmenį įgyvendinant UNESCO veiklos programas. Nacionalinės komisijos vadovaujasi Nacionalinių UNESCO komisijų chartija (Charter of National Commissions for UNESCO).