Eduardas Vaitkus gimė 1956 metų spalio 3 d. Kaune. 1973 metais baigė Kauno S. Neries vidurinę mokyklą, 1979 metais – Kauno medicinos instituto Gydomąjį fakultetą. Yra habilituotas daktaras.
1979-1980 m. dirbo Respublikinėje Kauno Klinikinėje ligoninėje gydytoju internu. 1980-1983 m. dirbo TSRS MMA Eksperimentinės Endokrinologijos ir Hormonų Chemijos Instituto Kauno filialo cukrinio diabeto laboratorijoje jaunesniuoju moksliniu bendradarbiu. 1996-1998 metais įmonėje „B. Braun Medical“ dirbo marketingo vadovu. 1997-2002 m. KMU hematologijos klinikos docentas. 2005-2006 m. dirbo sveikatos apsaugos ministro patarėju. 2002-2010 KMU hematologijos klinikos profesorius. 2012-2014 m. Kauno klinikinės ligoninės direktoriaus patarėjas, 1983-2018 m. LSMU Ligoninės Kauno klinikos gydytojas.
Moka anglų, rusų kalbas.
Informacija parengta pagal vrk.lt duomenis.